CONFIPETROL consciente de la necesidad de satisfacer las necesidades y expectativas de sus grupos de interés, mantiene un Sistema Integrado de Gestión (SIG), con base en las normas ISO 9001:2015 para la Gestión de Calidad, OHSAS 18001:2007 para la Gestión de Seguridad, Salud Ocupacional , la ISO 14001:2015 para la Gestión Ambiental y la certificación Norsok S-006 (Sistema de Gestión HSE)  sistemas actualmente certificados por el Instituto Colombiano de Normas Técnicas y Certificación ICONTEC para su casa matriz y sus subsidiarias.